O TrainMos II concentrou-se nos desafios relacionados com o desenvolvimento das auto-estradas do mar, do transporte marítimo e do sistema multimodal de transportes da UE, com particular ênfase na qualificação e formação dos que trabalham no setor. Um dos principais objetivos do projeto era criar um programa de formação certificado, baseado em diferentes módulos, que incluía um Mestrado Europeu, um Curso de Pós-Graduação e um Curso Profissional de Formação Contínua. Como beneficiária do TrainMos II, a Magellan desenvolveu, promoveu e implementou diferentes cursos de formação contínua: Intermodalidade e Gestão do Transporte Marítimo, Sustentabilidade e Logística.